Aide Malika

Dr. Malika Aid a fait ses études de premier cycle en génie informatique à l'université de Tizi-ouzou ; Algérie. Pour sa thèse d'ingénierie, elle a développé un modèle basé sur l'apprentissage automatique pour prédire les changements météorologiques en utilisant la distribution et la densité des nuages et en analysant des images satellites. Elle s'installe au Canada en 2004.Après une mineure en biochimie et biologie moléculaire, elle se joint à l'équipe du Dr Sylvie Mader à l'Institut de recherche en immunologie et en cancérologie (IRIC) de Montréal pour sa maîtrise et son doctorat. en biologie computationnelle et des systèmes.

 

Au cours de son doctorat, elle a travaillé sur la caractérisation des mécanismes de régulation transcriptionnelle du récepteur des œstrogènes ERalpha et elle a développé un outil informatique pour prédire les sites de liaison à l'ADN des facteurs de transcription à l'aide d'ensembles de données ChIP-Seq et ChIP-chip. Ce logiciel a ensuite été utilisé pour identifier de nouveaux partenaires transcriptionnels du récepteur alpha des œstrogènes et de leurs gènes cibles en aval. Après son doctorat, elle a rejoint le groupe du Dr Sekaly à VGTI Florida pour son post-doctorat. Au cours de son post-doc au sein du groupe de Sekaly, son travail s'est concentré sur le développement et la mise en œuvre d'approches de biologie systémique pour identifier les signatures d'expression génique qui prédisent la protection et l'acquisition des infections par le VIH et le VIS.

 

En 2016, elle a rejoint le laboratoire du Dr Dan Barouch au Center for Virology and Vaccine Research de la Harvard Medical School; Ses recherches en cours portent sur le développement et la mise en œuvre d'approches informatiques de pointe pour répondre à des questions clés en immunologie fondamentale, pathogénie des maladies et développement de vaccins ; analyser et intégrer des ensembles de données multi-omiques qui incluent la transcriptomique, l'épigénomique, la protéomique, la métabolomique et la séromique générées à l'aide d'analyses à haut débit telles que l'ARN-Seq en masse, l'ARN-Seq unicellulaire, le NGS, la mésoéchelle, la sérologie des systèmes et le flux à haute dimension cytométrie. L'un de ses intérêts de recherche est d'élucider les mécanismes qui régulent l'établissement/le maintien de la latence et de la persistance du VIH.